Basic bachelor course introducing the digital image processing field
Read moreThe Centre for Biomedical Image Analysis (CBIA) offers image processing/analysis courses at all levels: bachelor, master, Ph.D., and lifelong. The courses cover from the basics of signal/image acquisition and processing to specialized advanced image analysis topics. The Image Processing and Analysis courses are offered in the frame of the bachelor study programme Informatics, specialization Visual Informatics, and in the frame of the master study programme Visual Informatics, specialization Image Processing and Analysis.
Basic bachelor course introducing the digital image processing field
Read moreIntermediate bachelor course giving overview in digital image processing
Read moreThe students solve interesting digital image processing projects and present their results to others.
Read moreSeminar of the Centre for Biomedical Image Analysis focused on discussing bioimage analysis problems and solutions
Read moreThe course is focused on state-of-the-art mathematically well-founded methods of digital image analysis and processing.
Read moreMaster course discussing problems that arise from object digitalization and their representation by the set of points on a grid. Especially, it deals with measurent geometric as well as topologic properties of digital sets (distance, length, volume, etc.).
Read moreAdvanced master course on commonly used image filtering techniques (lossy/lossless compression, resampling, deconvolution) with the focus on orthogonal transforms (Fourier, Wavelet, PCA)
Read moreAdvanced master course on mathematical morphology theory and algorithms with its application mostly to grayscale digital images
Read moreMaster course on principles of image acquisition with focus on optical image formation and digital image detection
Read moreIntroduction into biochemistry, especially structure and function of biomolecules and their roles in the cell
Read moreIntroduction into molecular biology and into general processes by which the cells express their genetic information
Read moreBasics of biology, especially chemical structure of living organisms, cell biology, genetics, evolution and animal physiology
Read morePopular topics of cloning, GMO, civilization and epidemic diseases, genome therapy, evolution and future of Homo sapiens, (eco)toxicology
Read moreCílem této práce bude důkladné seznámení se s principy generativního modelování s využitím principů soupeřících neuronových sití a následné funkční řešení ve vhodném programovacím jazyce.
Cílem práce je naimplementovat anisotropní difúzní filtr řízený tensorem fázové kongruence a experimentálně ověřit jeho možnosti na multidimenzionálních obrazových datech.
Cílem této práce je navrhnout a implementovat aplikaci pro semiautomatickou analýzu trasologických obrazových dat podešví obuvi.
Cílem této práce je reimplementovat metody segmentace obrazu využívající parametrické aktivní křivky podle existující implementace v Matlabu a začlenit je do výukové aplikace PA166-Tester včetně podpůrného uživatelského rozhraní.
We offer a PhD position in our group. Click on the title for more details.
Student bude provádět simulace zkreslení umělých objektů pomocí optické soustavy (nástroj je k dispozici) a na zkreslených objektech bude provádět měření (délky, polohy, objemu, apod.) a porovná naměřené hodnoty s originálem. Popíše závislost nepřesností měření na různých faktorech (parametry optiky, množství šumu, parametry nastavované při analýze obrazu a měřeních).
Cílem je vyvinout jednoduchou aplikaci pro počítání mincí včetně nominální hodnoty, např. pro účely Noci vědců.
Cílem projektu je implementovat a otestovat algoritmus pro adaptivní filtrování obrazu, který je založený na morfologických amébách
Cílem projektu je naimplementovat a experimentálně vyzkoušet postup provádějící rozklad obrazu do superpixelů s využitím globální optimalizace pomocí diferenciální evoluce.
Cílem projektu je naimplementovat a experimentálně vyzkoušet metodu na detekci buněk ve 2D mikroskopických obrazech.
Automatické měření tloušťky vláken ve spolupráci s firmou Tescan
Automatizovaná detekce bodů Pg', Li', Ls', Pn' v rámci kefalometrické analýzy v měkkých tkáních
Úkolem je v záznamu sportovního utkání detekovat hráče, na nich čísla a ty rozpoznat. Ve spolupráci s firmou Daite, s.r.o.
Řešitel tohoto projektu naprogramuje a otestuje novou metodu, která slouží k charakterizaci vzhledu obrazových dat na základě textury. Důležitou vlastností této metody je nezávislosti výsledků analýzy na otočení vstupního obrazu.
Řešitel tohoto projektu nastuduje, naprogramuje a následně otestuje vybranou metodu sloužící k rekonstrukci obrazových dat ze snímků pořízených pomocí fázového kontrastu.
Cílem této práce bude nastudovat problematiku štěpení výpočtu konvoluce nad velkoobjemovými daty pomocí přístupu 'overlap-save' a 'overlap-add'. Student navrhne a implementuje matlabovskou funkci realizující kombinaci těchto algoritmů.
Cílem této práce je navrhnout a implementovat aplikaci pro semiautomatickou analýzu trasologických obrazových dat podešví obuvi.
Cílem této práce je naimplementovat a experimentálně vyzkoušet postup provádějící rozklad obrazu do superpixelů s využitím globální optimalizace pomocí diferenciální evoluce.
Cílem této práce je reimplementovat metody segmentace obrazu využívající parametrické aktivní křivky podle existující implementace v Matlabu a začlenit je do výukové aplikace PA166-Tester včetně podpůrného uživatelského rozhraní.
Cílem této práce bude důkladné seznámení se s principy generativního modelování s využitím principů soupeřících neuronových sití a následné funkční řešení ve vhodném programovacím jazyce.
Cílem práce je naimplementovat anisotropní difúzní filtr řízený tensorem fázové kongruence a experimentálně ověřit jeho možnosti na multidimenzionálních obrazových datech.
Práce se věnuje kompresi různých druhů biomedicínských obrazů. Je nutné provést testování různých kompresních algoritmů a zhodnotit závislost přijatelnosti kvality obrazu (nejenom vizuálně, ale i pro následnou analýzu) na kompresním poměru. Přijatelnost bude hodnocena porovnáním výsledků analýzy komprimovaného obrazu oproti analýze na originálu.
Student bude provádět simulace zkreslení umělých objektů pomocí optické soustavy (nástroj je k dispozici) a na zkreslených objektech bude provádět měření (délky, polohy, objemu, apod.) a porovná naměřené hodnoty s originálem. Popíše závislost nepřesností měření na různých faktorech (parametry optiky, množství šumu, parametry nastavované při analýze obrazu a měřeních).
We offer a PhD position in our group. Click on the title for more details.